MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966 chromosome

Total Repeats: 103020

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008570	GGC	2	6	238145	238150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117618930
5002	NC_008570	ATG	2	6	238164	238169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117618930
5003	NC_008570	GTG	2	6	238170	238175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117618930
5004	NC_008570	GCTTG	2	10	238195	238204	0 %	40 %	40 %	20 %	117618930
5005	NC_008570	CAGG	2	8	238209	238216	25 %	0 %	50 %	25 %	117618930
5006	NC_008570	GCC	2	6	238244	238249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117618930
5007	NC_008570	GAT	2	6	238253	238258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117618930
5008	NC_008570	AGC	2	6	238269	238274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618930
5009	NC_008570	CAG	3	9	238298	238306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618930
5010	NC_008570	CAGAC	2	10	238308	238317	40 %	0 %	20 %	40 %	117618930
5011	NC_008570	GCC	2	6	238328	238333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117618930
5012	NC_008570	GCCACC	2	12	238383	238394	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	117618930
5013	NC_008570	GTA	2	6	238424	238429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117618930
5014	NC_008570	GCA	2	6	238485	238490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618930
5015	NC_008570	GTA	2	6	238511	238516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117618930
5016	NC_008570	CAG	2	6	238544	238549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618930
5017	NC_008570	CAGG	2	8	238584	238591	25 %	0 %	50 %	25 %	117618930
5018	NC_008570	ATG	2	6	238694	238699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117618650
5019	NC_008570	GCC	2	6	238720	238725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117618650
5020	NC_008570	CAT	2	6	238749	238754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117618650
5021	NC_008570	GGC	2	6	238782	238787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117618650
5022	NC_008570	CGA	2	6	238799	238804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618650
5023	NC_008570	AG	3	6	238836	238841	50 %	0 %	50 %	0 %	117618650
5024	NC_008570	GAT	2	6	238905	238910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117618650
5025	NC_008570	CTG	2	6	238911	238916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117618650
5026	NC_008570	CAG	2	6	238968	238973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618650
5027	NC_008570	CTG	2	6	239016	239021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117618650
5028	NC_008570	GCC	2	6	239025	239030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117618650
5029	NC_008570	GGGC	2	8	239061	239068	0 %	0 %	75 %	25 %	117618650
5030	NC_008570	CAGC	2	8	239127	239134	25 %	0 %	25 %	50 %	117618650
5031	NC_008570	TTG	2	6	239137	239142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117618650
5032	NC_008570	CGG	2	6	239152	239157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117618650
5033	NC_008570	TGA	2	6	239198	239203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117618650
5034	NC_008570	TGTC	2	8	239215	239222	0 %	50 %	25 %	25 %	117618650
5035	NC_008570	GCTCAC	2	12	239277	239288	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	117618650
5036	NC_008570	GCC	2	6	239346	239351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117618650
5037	NC_008570	AGC	2	6	239362	239367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618650
5038	NC_008570	CGT	2	6	239459	239464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117618650
5039	NC_008570	CCA	2	6	239549	239554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117618650
5040	NC_008570	GCT	2	6	239567	239572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117618650
5041	NC_008570	TGG	2	6	239588	239593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117618650
5042	NC_008570	CCA	2	6	239603	239608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117618650
5043	NC_008570	ATG	2	6	239623	239628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117618650
5044	NC_008570	TGA	2	6	239672	239677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117618650
5045	NC_008570	GAT	2	6	239679	239684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117618650
5046	NC_008570	CTT	2	6	239706	239711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117618650
5047	NC_008570	CAGGAT	2	12	239769	239780	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	117618650
5048	NC_008570	CAG	2	6	239898	239903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618650
5049	NC_008570	GTT	2	6	239982	239987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117618650
5050	NC_008570	GAT	2	6	240111	240116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117618650
5051	NC_008570	TCA	2	6	240119	240124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117618650
5052	NC_008570	CGA	2	6	240152	240157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618650
5053	NC_008570	TGC	2	6	240167	240172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117618650
5054	NC_008570	TTG	2	6	240199	240204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117618650
5055	NC_008570	TCTG	2	8	240259	240266	0 %	50 %	25 %	25 %	117618650
5056	NC_008570	ATG	2	6	240271	240276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117618650
5057	NC_008570	ACCTTG	2	12	240393	240404	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	117618964
5058	NC_008570	GAT	2	6	240410	240415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117618964
5059	NC_008570	CAC	2	6	240496	240501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117618964
5060	NC_008570	GGC	2	6	240548	240553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117618964
5061	NC_008570	GGC	2	6	240572	240577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117618964
5062	NC_008570	GGT	2	6	240625	240630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117618964
5063	NC_008570	GGC	2	6	240674	240679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117618964
5064	NC_008570	GCG	2	6	240708	240713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117618964
5065	NC_008570	CGC	2	6	240785	240790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117618964
5066	NC_008570	GCC	2	6	240896	240901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117618964
5067	NC_008570	CAGC	2	8	240937	240944	25 %	0 %	25 %	50 %	117618964
5068	NC_008570	GC	3	6	240943	240948	0 %	0 %	50 %	50 %	117618964
5069	NC_008570	CCA	2	6	240949	240954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117618964
5070	NC_008570	GGAA	2	8	240955	240962	50 %	0 %	50 %	0 %	117618964
5071	NC_008570	ACC	2	6	241008	241013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117618964
5072	NC_008570	GAT	2	6	241019	241024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117618964
5073	NC_008570	GAC	2	6	241123	241128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618964
5074	NC_008570	CCTTGA	2	12	241171	241182	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	117618964
5075	NC_008570	CTTTGT	2	12	241186	241197	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	117618964
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5084	NC_008570	GGC	3	9	241981	241989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117619159
5085	NC_008570	CTG	2	6	242075	242080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619159
5086	NC_008570	CCA	2	6	242086	242091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117619159
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5089	NC_008570	CGA	2	6	242182	242187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117619159
5090	NC_008570	CG	3	6	242202	242207	0 %	0 %	50 %	50 %	117619159
5091	NC_008570	AAG	2	6	242231	242236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117619159
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5107	NC_008570	CAA	2	6	242980	242985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117619159
5108	NC_008570	CGA	2	6	242992	242997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117619159
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5239	NC_008570	GGC	2	6	248162	248167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117618967
5240	NC_008570	GC	3	6	248166	248171	0 %	0 %	50 %	50 %	117618967
5241	NC_008570	CAG	2	6	248207	248212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618967
5242	NC_008570	GAT	2	6	248260	248265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117618967
5243	NC_008570	TCC	2	6	248271	248276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117618967
5244	NC_008570	CGA	2	6	248344	248349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618967
5245	NC_008570	CTG	2	6	248376	248381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117618967
5246	NC_008570	TG	4	8	248438	248445	0 %	50 %	50 %	0 %	117618967
5247	NC_008570	GCC	2	6	248490	248495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117618967
5248	NC_008570	CAG	2	6	248543	248548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618967
5249	NC_008570	GCC	2	6	248650	248655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117618967
5250	NC_008570	CGG	2	6	248747	248752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117618967
5251	NC_008570	CGGCT	2	10	248792	248801	0 %	20 %	40 %	40 %	117618967
5252	NC_008570	GCT	2	6	248812	248817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117618967
5253	NC_008570	GTA	2	6	248837	248842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117618967
5254	NC_008570	GCTCC	2	10	248855	248864	0 %	20 %	20 %	60 %	117618967
5255	NC_008570	TGCT	2	8	248872	248879	0 %	50 %	25 %	25 %	117618967
5256	NC_008570	ATG	2	6	248930	248935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117618967
5257	NC_008570	ACC	2	6	248958	248963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117618967
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5259	NC_008570	GT	3	6	249118	249123	0 %	50 %	50 %	0 %	117618967
5260	NC_008570	TC	3	6	249132	249137	0 %	50 %	0 %	50 %	117618967
5261	NC_008570	CAG	2	6	249730	249735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117619403
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5263	NC_008570	ATC	2	6	249821	249826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117619403
5264	NC_008570	TCG	2	6	250170	250175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619017
5265	NC_008570	CGC	3	9	250234	250242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117619017
5266	NC_008570	CTT	2	6	250264	250269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117619017
5267	NC_008570	TCG	2	6	250284	250289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619017
5268	NC_008570	TGC	2	6	250293	250298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619017
5269	NC_008570	AGCA	2	8	250304	250311	50 %	0 %	25 %	25 %	117619017
5270	NC_008570	CTG	2	6	250321	250326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619017
5271	NC_008570	GTG	2	6	250343	250348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117619017
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5273	NC_008570	GC	3	6	250411	250416	0 %	0 %	50 %	50 %	117619017
5274	NC_008570	TCAG	2	8	250467	250474	25 %	25 %	25 %	25 %	117619017
5275	NC_008570	ACT	2	6	250488	250493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117619017
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5283	NC_008570	CGC	2	6	250985	250990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117619712
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5322	NC_008570	CACC	2	8	252872	252879	25 %	0 %	0 %	75 %	117621458
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5353	NC_008570	CGA	2	6	254349	254354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621504
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5359	NC_008570	CAG	2	6	254697	254702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117620549
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5362	NC_008570	GCCGG	2	10	254787	254796	0 %	0 %	60 %	40 %	117620549
5363	NC_008570	GCC	2	6	254806	254811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117620549
5364	NC_008570	TCA	2	6	254818	254823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117620549
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5395	NC_008570	GTGGA	2	10	255943	255952	20 %	20 %	60 %	0 %	117617597
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5481	NC_008570	CAG	2	6	259336	259341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618715
5482	NC_008570	CG	3	6	259429	259434	0 %	0 %	50 %	50 %	117618715
5483	NC_008570	CGG	2	6	259445	259450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117618715
5484	NC_008570	ACA	3	9	260604	260612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117620884
5485	NC_008570	AGC	2	6	260630	260635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117620884
5486	NC_008570	CTC	2	6	260673	260678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117620884
5487	NC_008570	CCG	2	6	260723	260728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117620884
5488	NC_008570	GCC	2	6	260764	260769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117620884
5489	NC_008570	GCC	2	6	260814	260819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117620884
5490	NC_008570	GCT	2	6	260835	260840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117620884
5491	NC_008570	CGA	2	6	260928	260933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117620884
5492	NC_008570	TGG	2	6	260966	260971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117620884
5493	NC_008570	CTG	2	6	260983	260988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117620884
5494	NC_008570	GGC	2	6	261018	261023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117620884
5495	NC_008570	GCC	2	6	261068	261073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117620884
5496	NC_008570	C	6	6	261089	261094	0 %	0 %	0 %	100 %	117620884
5497	NC_008570	AGG	2	6	261101	261106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117620884
5498	NC_008570	TGG	2	6	261122	261127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117620884
5499	NC_008570	TCA	2	6	261203	261208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117620884
5500	NC_008570	CGG	2	6	261281	261286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117620884

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